感染的快速测试可标识不明原因的整个身体 

所有功能于一身的“宏基因组”试验进展努力消除冗长的诊断  

通过 杰弗里·诺里斯

由现金赌钱游戏的科学家开发出一种单一的临床化验将患病通过识别任何微生物恶棍困扰在短短六小时加速病人适当的药物治疗严重。 照片由伊丽莎白秋天

现金赌钱游戏的科学家已经开发出能够对微生物恶棍困扰在短短六小时患者归零的一个临床实验室测试 - 无论什么体液进行取样,类型或传染性病原体的种类,还是医生开出任何线索,以什么的罪魁祸首可能。  

该测试将是一个救星,对于超速适当的药物治疗重病,并应变换传染性疾病被诊断的方式说,这项研究的作者,出版十一月9 自然医学

这里的进步是,我们可以检测到来自任何体液的任何感染,无需特殊处理或加工为每个不同的体液,”研究相应的作者说: 查尔斯钊博士,教授在实验室医学和导演的UCSF部门UCSF雅培病毒诊断和发现中心。 “这是一个简单的过程。” 

常规诊断测试被设计成仅检测一种或有时的潜在病原体小面板。与此相反,新的协议使用强大的“下一代” DNA测序技术,以帐户用于对样品中的所有DNA,其可以是来自任何物种 - 人类,细菌,病毒,寄生虫或真菌。临床医生不需要有犯罪嫌疑人的想法。识别匹配时,新的测试依赖于专门开发的分析软件样本大规模的基因组数据库,覆盖所有已知的病原体比较DNA序列。 

钊和同事 现金赌钱游戏中心下一代精确诊断 首先开发这种方法来识别在脑炎的病例在脊髓液传染媒介和脑膜炎,特别是 帮助拯救了长期生病的男孩的生活, 然后 验证使用的协议作为临床试验 现在正被由医生在医院下令全国。 

Chiu和合作者还开发了败血症,医院病人的头号杀手,一个类似的血液测试,而其他测试使用呼吸流体诊断肺炎的传染性病因。 

但这些试验的设计工作只与特定的体液,不是全部。不幸的是,医生往往是不确定的病人的传染源,而且必须同时发送OFF样本几个不同体液的实验室分析。 

在新的研究中,现金赌钱游戏的研究人员,包括中心下一代精密诊断的联合创始人 乔derisi博士,和 史蒂夫·米勒博士,他们的新单协议相比业绩“宏基因组” DNA测试的金标准实验室文化为基础的测试,现在标准的基于PCR的DNA测试,使用两个大功率的DNA测序技术来诊断细菌或真菌感染。一个是由牛津纳米孔技术制造的便携式,袖珍式音序器,它可以在六小时内,迄今完成测序已经被研究实验室几乎完全使用。另一个是Illumina测序,可以同时并行地处理多个样本,并且已经在某些临床实验室中使用(包括在UCSF),但是这需要24小时以上才能完成。 

研究人员分析体液 - 180个样品从和周围的肺,腹膜腔,脓填充脓肿,脊髓,关节和其他网站如扁桃体流体甚至玻璃体(眼)流体 - 从160名患者,144其中住院治疗。 

与金标准培养和PCR相比,研究人员诊断细菌79%,并通过Illumina测序真菌感染的91%,而细菌75%,而纳米孔测序真菌感染的91%。 

使用宏基因组DNA测试,邱和他的同事们也能诊断感染七12的患者,其疾病的标准培养或基于PCR的DNA测试后一直保持未确诊。 

我们认为这一个宏基因组测试可用来替代所有基于PCR的DNA测试,现在被用来检测数百个生物不能被充分培养,”超说。 

研究人员在做这个测试在现金赌钱游戏和其他地方的临床实践标准的一部分,希望对FDA监管部门的批准,现在移动。